• يضم ممثلين عن وزارات التربية والتعليم في الدول العربية الأعضاء في اليونسكو، إضافة إلى خبراء وممثلين من منظمات وهيئات إقليمية ودولية.
• يتولى إقرار السياسات العامة والخطط الاستراتيجية ومتابعة تنفيذها.
الإدارة التنفيذية :
• يرأسها المدير العام للمركز، وتضم الإدارات المتخصصة والكوادر الفنية.
• مسؤولة عن تنفيذ البرامج والمبادرات المعتمدة من مجلس الإدارة وضمان تحقيق الأهداف بكفاءة.
الأمانة الفنية للمجلس :
• تتولى مهام التنسيق والدعم الفني والإداري لمجلس الإدارة ولجان العمل المختلفة.
• تضمن متابعة القرارات والإجراءات، وتعمل كحلقة وصل بين المركز وشركائه الإقليميين والدوليين.
تعمل هذه الهيئات معًا لقيادة جهود المركز في تعزيز جودة وتميز التعليم في الدول العربية، من خلال إعداد البحوث، تطوير السياسات، بناء القدرات، وإطلاق المبادرات الإبداعية بالشراكة مع اليونسكو والمؤسسات العالمية.